Игры с генами

Биологи выяснили, как обезвредить клетки одного из самых опасных типов рака молочной железы — трижды негативного рака груди. Дело в том, что данный вид онкологии не реагирует на гормональную терапию и химиотерапию. Более того, после лечения болезнь может рецидивировать. Однако ученые нашли способ побороть недуг. Использовав передовую технологию генетического редактирования CRISPR, исследователи заблокировали активность одного […]

Искусственные нейронные сети (ИНС) могут использоваться для выявления генов, связанных с теми или иными заболеваниями. К такому выводу пришли ученые Линчёпингского университета в Швеции. Исследователи надеются, что в будущем их метод сможет успешно применяться в точной медицине и персонализированном лечении. Шведские ученые использовали искусственный интеллект для поиска биологических сетей. Алгоритм похож на тот, который применяется […]
Светлана Макина

Правительство РФ поручило Минсельхозу совместно с федеральными органами исполнительной власти рассмотреть рекомендации Совета Федерации по итогам совещания "О национальной системе защиты прав потребителей" в части регулирования производства и оборота ГМО-продукции, сообщил журналистам в понедельник глава аграрного комитета СФ Алексей Майоров.

Шведские ученые доказали, что алгоритм может самостоятельно находить закономерности в больших массивах данных об экспрессии генов и выделять те из них, которые связаны с различными заболеваниями. Удивительно в их эксперименте то, что нейросеть сделала правильные выводы, получив на входе неразмеченные данные.

Исследователи кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ впервые обнаружили в здоровом мозге функциональный амилоид.

Современные технологии позволяют воссоздать возбудителя опасной инфекции на основе опубликованного генетического кода. Это станет важным шагом в изучении природы вируса и разработке методов борьбы с ним. Однако скептики опасаются, что копии могут оказаться в руках злоумышленников.

Минсельхозу поручили рассмотреть вопрос об обороте ГМО-продукции

Это крупнейшее на сегодняшний день исследование генетики храпа. Многие из найденных генов ранее были связаны с дыхательными, кардио-метаболическими, неврологическими и психиатрическими особенностям.

Биолог и популяризатор науки Александр Панчин расскажет, как получается, что в научные журналы проникают работы с очевидными и неочевидными ошибками, что нашли в геноме снежного человека, что такое скрытая гомеопатия и может ли прослушивание песен The Beatles омолаживать.

Исследователи из Стэнфорда разработали биологический инструмент, который может не только обнаруживать дефектные генетические схемы, но и «отлаживать» их. Эта система может потенциально облегчить уничтожение раковых клеток. Статья исследователей опубликована в журнале Molecular Cell.

С 2020 года в систему ОМС были включены онкогематологическая помощь и молекулярно-генетические исследования, необходимые при диагностики онкологических заболеваний у детей.

Схема мышления человека
Мышцы и мышление имеют не только общее однокоренное звучание, но и общие смысловые значения.
Мышцами человек воздействует на окружающий мир - мыслями совершает познание и изменяет сознание. Мыслям необходимы сокращения рецепторов мышц и получение нервных импульсов проприоцепций, из которых и создаются мысленные образы и операции.
В египетской антропологии сердце считалось духовным центром человека, творческие люди утверждают, что из сердца достают они гениальные мысли. Данные утверждения не лишены смысла: мышцы сердца могут использоваться для создания утонченных мыслей, а после они получают речевую оболочку.
Как мы определились с самого начала, ДНК нейронов является мыслительным центром, центром памяти. Необходимость преобразовывать информацию в кванты и требуется для работы с ДНК, так как квант по одному нервному волокну направляется к определенному

Реконструкция внешнего вида неандертальца, выполненная в 1910 году

Американские ученые выяснили, как унаследованные от неандертальцев гены влияют на здоровье современных людей. Результаты работы опубликованы в журнале Science.
О том, что древние люди, вышедшие из Африки около 60 тысяч лет назад, скрещивались с встреченными в Европе 10 тысяч лет спустя неандертальцами, стало известно в 2010 году. Генетическое исследование показало, что у неафриканского населения Земли от полутора до четырех процентов наследственного материала унаследовано от неандертальцев. Какую роль играют эти гены, оставалось неизвестным.
Исследовательский коллектив из ведущих биомедицинских институтов США сопоставили типичные неандертальские варианты генов в биообразцах более чем 28 тысяч взрослых людей

Выращивание новых органов из стволовых клеток, генная терапия, редактирование генома, клонирование, генетически модифицированные организмы... Наверное, нет сегодня более горячих и актуальных тем, чем эти. В то же время трудно найти темы, которые бы сопровождались таким количеством мифов, как вышеперечисленные. Внести ясность в эту сложную и интересную проблематику мы попросили академика Всеволода Арсеньевича Ткачука, декана факультета фундаментальной медицины, директора Института регенеративной медицины МГУ им. М.В. Ломоносова.
— Всеволод Арсеньевич, в этом году была утверждена Федеральная научно-техническая программа развития генетических технологий на 2019-2027 гг. Эта же тема возникла в связи с созданием научно-технологической долины «Воробьевы горы». Почему сейчас такой интерес к генетическим технологиям? Это только у нас или во всем мире?
— Интерес к генетике был всегда и везде.

В рамках глобального проекта Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) исследователи еще раз подтвердили, что вирусы являются одними из ключевых драйверов некоторых типов рака. Они описали известные и новые ассоциации вирусов с онкогенными мутациями, их подписями в геноме, профилями активности генов и выживаемостью пациентов. Работа опубликована в журнале .
На днях завершился амбициозный проект PCAWG, — результат коллаборации двух основных платформ для исследования генетики рака (TCGA и ICGC) и интернациональной группы приглашенных ученых. Целью проекта было сравнить основные типы рака в разных тканях. Для этого были сделаны пары полных геномов для здоровой и опухолевой ткани 2658 раковых пациентов, а для 1222 из них

JR Korpa / Unsplash

Бельгийские неврологи предлагают имитировать в лаборатории опыт смерти. Из работы с тяжелыми больными они знают, что пограничные состояния сложнее, чем мы привыкли думать, — исследуя их, можно глубже понять, как устроено сознание. Наука долго не подступалась к этому вопросу: мы до сих пор не знаем толком, что такое человек с точки зрения нейробиологии и где его экзистенциальные и биологические границы. Но ученые уже картируют пространство нашего сознания. По просьбе «Медузы» научный журналист Денис Тулинов рассказывает, что уже известно о том, как устроено пространство измененных состояний сознания, и откуда в нем пустые места.

Я ощутил

Пигментный ретинит — неизлечимое и непрофилактируемое ослепляющее генетическое заболевание зрения, которое поражает 1 из 4000 человек (правда, редко приводящее к совсем полной слепоте).
Новое исследование показало, что система комплемента, часть врожденной иммунной системы, комплекс сложных белков, постоянно присутствующих в крови, играет защитную роль для замедления дегенерации сетчатки в мышиной модели пигментного ретинита. Это удивительное открытие противоречит более ранним исследованиям других глазных заболеваний, предполагавших, что система комплемента ухудшает дегенерацию сетчатки. На срезах сетчатки у пациента с пигментным ретинитом обнаружена микроглия (зеленая), мигрирующая в слой фоторецепторов (синяя) после начала дегенерации. На вставке показана микроглия, экспрессирующая часть системы комплемента С3 (красный цвет), которая возникла в контексте дегенерации

При бесполом размножении многие слабовредные мутации распространяются вместе с полезными, а полезные мутации, возникшие в разных геномах, не могут объединиться и конкурируют друг с другом. Половой процесс помогает организмам быстрее адаптироваться к меняющимся условиям среды. Ранее в эволюционном эксперименте на гаплоидных дрожжах эти теоретические представления блестяще подтвердились. В новом исследовании бесполые диплоидные популяции адаптировались не хуже популяций, способных к половому процессу.

При бесполом размножении многие слабовредные мутации распространяются вместе с полезными, а полезные мутации, возникшие в разных геномах, не могут объединиться и конкурируют друг с другом. Половой процесс помогает организмам быстрее адаптироваться к меняющимся условиям среды. Ранее в эволюционном эксперименте на гаплоидных дрожжах эти теоретические представления блестяще подтвердились. В новом исследовании бесполые диплоидные популяции адаптировались не хуже популяций, способных к половому процессу.

В геноме человека лишь 2% структуры ДНК ответственны за структуру молекул в нашем организме. Бóльшая часть структуры ДНК содержит информацию, которую мы прочитали, но пока не поняли

В Швейцарской высшей технической школе Цюриха создан первый в мире искусственный бактериальный геном. Один из экспертов, знакомый с деталями проекта — ученый-биоинженер Бет Кристен — сообщил, что скоро людям будут доступны формы жизни, у которых нет никаких предков, в первую очередь бактерии. Биоинженеры будут использовать компьютеры для «разработки» живых организмов и приспособлять их для применения […]
Ольга Сафонова

Фиксируя генетические изменения в коронавирусе, ученые составили четкую картину его распространения, - пишет sciencenews.org.

Анализ основ жизнедеятельности и развития живой материи с момента её зарождения до современного состояния биоценоза с позиций различных научных подходов позволяет утверждать, что основным свойством и одновременно механизмом её совершенствования является адаптация — приспособление к изменяющимся условиям окружающей среды.
При этом, если на ранних этапах зарождения живых существ их совершенствование происходило на уровне обменных процессов, то затем адаптивные механизмы всё больше проявляются на уровне функциональном — повышается их активность и плодовитость. По мере остывания планеты возникла необходимость в использовании биоценозом энергии Солнца, что было достигнуто формированием процессов фотосинтеза некоторыми бактериями и растениями. Однако при этом как побочный продукт фотосинтеза в атмосфере стал накапливаться кислород — мощный окислитель, который произвёл революцию в развитии живой

Переданная от ранее неизвестной, ныне вымершей популяции гоминидов ДНК выполняет такие функции, как подавление опухоли и регуляция гормонов, - пишет sciencenews.org со ссылкой на Science Advances со ссылкой на Science Advances.

Мозг беременной и прозрачная почка, первооткрыватель генетического кода и аттосекундный рентгеновский лазер – таков наш ночной дайджест.

Группа анонимных активистов Earnest Project продает ДНК знаменитостей — в том числе, политиков и музыкантов. Так они хотят привлечь внимание к проблеме сбора персональных данных.

Как от майской мухи перейти к прочтению генетического кода, произвести фурор в Москве и затем превратиться из молекулярного биолога в нейроученого, рассказывает наш очередной выпуск рубрики «Как получить Нобелевку».

Исследователи кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ впервые обнаружили в здоровом мозге функциональный амилоид. Принято считать, что образование амилоидов — особой формы фибриллярных белков — приводит к болезням Альцгеймера, Паркинсона и Хантингтона. … Подробнее →

T-специалист Андрей Иванов о soft-процессорах, сверточной нейронной сети и системе обучения нейронных процессоров
Поговорим о будущем нейронных процессоров. В настоящее время мы имеем CPU (central processing unit) — центральный процессор, который поддерживает множество вычислений и стоит на всех компьютерах. На нем работают любые программы, но когда мы используем графику или запускаем игру, то используем графический процессор, у которого ограниченный набор функциональных возможностей, но высокая оптимизация нужных функций. Такой процессор называют специализированным.
Предпосылки для создания нейросетевых процессоров связаны с нейросетевой обработкой изображения. До 2013 года такого типа обработки не было. Существовали специальные алгоритмы, которые обрабатывали видео и изображения.

Оглядываясь назад на столетие кровавых революций, Мишель Фуко заметил, что «одна из самых разрушительных привычек современной мысли» заключается в отношении к  настоящему как к центральным событиям во всемирной истории.¹ Имея в виду последствия, к которым приводит тенденция модерна «героизировать» настоящее, Фуко отметил: «Вероятно, необходимо найти в себе смирение для того, чтобы признать, что время моей жизни не является неповторимым, фундаментальным и революционным моментом в истории, из которого всё начинается и которым всё заканчивается».² Быть может, проницательное назидание Фуко должно быть услышано теми, кто верит, что человечество находится в одном шаге от чего-то поистине революционного,

Ученые нашли доказательства существования загадочной «популяции призраков» — древних людей, которые жили в Африке около полумиллиона лет назад. Следы неизвестного предка появились, когда исследователи проанализировали геномы из западноафриканских популяций и обнаружили, что до пятой части их ДНК, по-видимому, происходило от пропавших родственников. Генетики подозревают, что предки современных западноафриканцев скрещивались с еще не обнаруженными архаичными людьми […]

Калифорнийские микробиологи обнаружили более 350 бактериофагов (вирусов бактерий) с крупным геномом, в котором закодированы многие элементы системы синтеза белков и ранее неизвестные варианты CRISPR-Cas, сообщается в Nature. Предполагается, что эти вирусы используют систему бактериального иммунитета CRISPR для борьбы с фагами-конкурентами.
читать далее

Регистрируя крошечные генетические изменения в вирусе, называемом коронавирусом, биолог Тревор Бедфорд из исследовательского центра рака в Сиэтле Fred Hutch и его коллеги выяснили не только на что способен этот вирус, но и его возраст.

Электронные медкарты москвичей будут включать данные по детской вакцинации. А в систему ОМС включили онкогематологическую помощь и молекулярно-генетические исследования, необходимые при диагностики рака у детей.

В рамках глобального проекта Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) исследователи еще раз подтвердили, что вирусы являются одними из ключевых драйверов некоторых типов рака. Они описали известные и новые ассоциации вирусов с онкогенными мутациями, их подписями в геноме, профилями активности генов и выживаемостью пациентов. Работа опубликована в журнале Nature Genetics. На днях завершился амбициозный проект […]

Ученые использовали новый инструмент для редактирования генов и добились значительного прогресса в экспериментах с животными. Результаты очень перспективны для лечения людей с различными наследственными заболеваниями, заявили исследователи.
читать далее

Накладывающиеся гены являются одним из поразительнейших открытий, которые удалось сделать при изучении ДНК. По сути, это опровержение любой эволюционной теории, предусматривающей ненаправленные разумом механизмы.
Накладывающиеся гены — это участки ДНК, которые несут одновременно несколько разных кодов для построения белков и их регулирования; эти коды совпадают и частично переплетаются, что не мешает им сохранять информационный контент. Помимо этого, есть гены, которые читаются справа-налево и слева-направо одновременно, при этом в каждом случае несут разную генетическую информацию. Накладывающиеся друг на друга гены могут кодировать белок или выполнять важные регуляторные функции. Это относительно недавнее открытие, и всё же несложно понять, что малейшие изменения в накладывающихся кодах будут летальными и естественный отбор просто-напросто не сохранит их в популяции и устранит подобного

Ощущение «сверхъестественного» возникает при отключении мозговых тормозов.
Мистический опыт можно описать по-разному: кто-то чувствует присутствие неких высших сил, кому-то открывается высшее знание, у кого-то меняется восприятие и т. д. У кого-то «мистика» случается в больнице, в палате интенсивной терапии, кого-то странные видения посещают при погружении в медитативный транс. (Уточним, что мы говорим не о клинических расстройствах, вроде шизофрении – при мистическом опыте человек понимает, что с ним случилось нечто необъяснимое, выходящее за пределы разумения.)
Обращаясь к высшим силам, не забудьте снять свой мозг с тормозов. (Фото Emma Rian / Corbis.)
Кора мозга человека; дорсолатеральная префронтальная кора располагается в лобных долях,

В рамках глобального проекта Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes(PCAWG) исследователи еще раз подтвердили, что вирусы являются одними из ключевых драйверов некоторых типов рака. Они описали известные и новые ассоциации вирусов с онкогенными мутациями, их подписями в геноме, профилями активности генов и выживаемостью пациентов.
читать далее

Исследование генома вейперов и курильщиков показало, что и у тех, и у других наблюдаются эпигенетические мутации, которые могут приводить к развитию раковых заболеваний.
читать далее

Генетические нарушения происходят еще до того, как в организме можно обнаружить диабет, выяснили ученые. Теперь они планируют разработать терапию, чтобы обратить вспять первые признаки зарождающейся болезни.
читать далее

<img src="https://naked-science.ru/wp-content/uploads/2020/02/Morning-lark.jpg" alt="Ученые рассказали о мутациях, которые сокращают длительность «внутренних суток»"/>Исследователи рассказали о генетических изменениях, которые заставляют спешить внутренние часы организма, сокращают циркадный цикл на несколько часов и превращают человека в «жаворонка».

Вероятно, их системы редактирования генома получится применить и в медицинских целях

Новые для науки вирусы паразитируют на бактериях и содержат необычно большие геномы. Кроме того, они используют ряд белков, характерных для бактерий и архей. Авторы полагают, что открытие позволит создать новые инструменты генного редактирования.

С 2020 года в систему ОМС были включены онкогематологическая помощь и молекулярно-генетические исследования, необходимые при диагностики онкологических заболеваний у детей.

Ученые использовали новый инструмент для редактирования генов и добились значительного прогресса в экспериментах с животными. Результаты очень перспективны для лечения людей с различными наследственными заболеваниями, заявили исследователи.

Новый метод изучения ДНК помог найти в геноме африканских Homo sapiens следы популяции неизвестных гоминидов. Метод предложен учеными из Калифорнийского университета, работа которых опубликована в журнале Science Advances.

<img src="https://naked-science.ru/wp-content/uploads/2020/02/homi0.jpg" alt="В геноме жителей Африки обнаружили ДНК неизвестного вида вымерших гоминид"/>Проанализировав геномы представителей западноафриканских народов, ученые обнаружили, что до 19 процентов их ДНК составляют гены, полученные от неизвестных вымерших гоминид.

Ученые всего мира ищут животное, от которого коронавирус 2019-nCoV передался человеку. Так как геном 2019-nCoV почти на 80% схож с геномом тяжелого острого респираторного синдрома ...

Чтобы прийти именно туда, куда нужно, наночастицы научили распознавать не только клетку-адресат, но и её окружение.

Идеальное лекарство должно одновременно само искать болезнь и лечить её – подобно волшебной стреле или волшебной пуле, которая сама ищет свою цель, куда бы вы ни стреляли. Концепцию медицинской «волшебной пули» более ста лет предложил Пауль Эрлих, но те лекарства, которыми мы до сих пор располагаем, ничего «волшебного» в себе не несут: они действуют не только на больные клетки, но и на здоровые.
Лекарство может стать идеальным, если оно будет приходить строго по адресу. Для этого используют отличия больных клеток от здоровых: молекулярные процессы в больных клетках

Генетически модифицированная культура, способная спасти миллионы жизней — так говорят о так называемом «золотом рисе», сорте, содержащем бета-каротина больше обычного. Золотой рис признан безопасной пищей и разрешён на Филиппинах, ранее регулирующие органы допустили его использование в США и Канаде. Но попадёт ли полезный продукт на стол тех, кого он должен спасать? Исследование, материалы которого опубликованы в журнале , свидетельствует об обратном.
«Многие многодетные семьи с дефицитом витамина A даже не имеют земли для выращивания риса, — говорит один из авторов публикации, профессор Гленн Дэвис Стоун (Glenn Davis Stone). — И те, кто живёт в горах, не будут сажать его, потому что он был создан на основе низинных разновидностей риса, известных как IR-64

Георгий Базыкин (iitp.ru) Мы находимся в разгаре эпидемии новой опасной инфекции, но достоверной информации о ней мало. В этой ситуации помогает молекулярная эпидемиология. Ход накопления мутаций эволюционирующим вирусом позволяет оценить важные параметры эпидемии даже при неточных официальных данных. Ситуация очень быстро меняется; все оценки, приведенные ниже, верны по состоянию на 9 февраля.
С чего все началось?
Сравнивая организмы друг с другом, эволюционные биологи многое могут узнать про их историю. Больше всего материала для сравнений содержится в нуклеотидных последовательностях, в случае коронавирусов — в последовательностях РНК. Текущая вспышка — пожалуй, первый случай возникновения нового патогена, когда генетические данные есть почти с самого начала.

«Искусственный интеллект на базе нейронных сетей невероятно глуп!» - заявил вице-президент Гугла Эндрю Мур в конце 2018 года [1]. Только представьте, как обидно звучат эти утверждения для неспециалистов. Вроде бы восстание машин ожидается со дня на день и тут такое заявление! Тем не менее господин Мур абсолютно прав. Без оговорок и скрытых смыслов. Искусственный интеллект в том виде, в котором он существует сегодня, это инструмент, который сложен, но не более интеллектуален, чем, скажем, драйвер Windows.
Если посмотреть на спектр решаемых ИИ задач, то можно увидеть, что в большинстве случаев это выявление или генерирование каких-либо шаблонов, понятных для человека. Ничего, кроме этого, нейронные сети не умеют. Искусственный интеллект бессмысленно использовать там, где не требуется распознать некий паттерн,

Ученые всего мира ищут животное, от которого коронавирус 2019-nCoV передался человеку. Так как геном 2019-nCoV почти на 80% схож с геномом тяжелого острого респираторного синдрома (SARS), в поисках естественного хозяина вируса взоры ученых были обращены на летучих мышей. Дело в том, что именно они оказались носителями SARS, поэтому исследователи полагают, что коронавирус их летучих “рук” […]

Алгоритм, который это сделал, научился вычислять «чужеродные фрагменты» ДНК без использования геномов древних людей

<img src="https://naked-science.ru/wp-content/uploads/2020/02/Vaping-health-web.jpg" alt="Изменения химических меток в геноме вейперов связаны с развитием рака"/>Исследование генома вейперов и курильщиков показало, что и у тех, и у других наблюдаются эпигенетические мутации, которые могут приводить к развитию раковых заболеваний.

Недавно ученые из биологической лаборатории MDI, Института исследований старения Бака и университета Нанкин потрясли медицинский мир, объявив о том, что им удалось продлить продолжительность жизни червей-нематод Caenorhabditis elegans на 500%. Черви C. elegans часто используются в исследованиях старения. Несмотря на то, что биологически они далеки от человека, эти организмы разделяют многие генетические пути с людьми.
читать далее

Генетические нарушения происходят еще до того, как в организме можно обнаружить диабет, выяснили ученые. Теперь они планируют разработать терапию, чтобы обратить вспять первые признаки зарождающейся болезни.

Вирусы нашли в 382 из 2658 свежеотсеквенированных раковых геномов

The Cherokee Nation, официальная организация объединения племен чероки, получила права и привилегию первой среди представителей коренных народов Северной Америки сделать свой вклад в генетическое хранилище семян на Шпицбергене. Известное также как Хранилище Судного дня, это специальное сооружение может хранить 2,5 млрд семян неограниченно долго – для будущих поколений. Сейчас оно в стадии заполнения, после формирования основного фонда различные этнические, политические и агротехнические структуры получают право сделать свой, уникальный вклад.

Вирусы — одни из самых маленьких форм жизни на нашей планете и в то же самое время одни из самых опасных. Постоянно развиваясь, вирусы становятся ...

В этом видео я использую генетический алгоритм и нейросеть, чтобы существа самостоятельно эволюционировали и обучались выполнять задачу.
Изначально они не даже знают, в чем состоит их задача. Все, что у них есть, это показатель того, на сколько успешно они справляются в симуляции.
GitHub:
https://github.com/Elco-/Evolution3D
Эволюция машинок:
https://rednuht.org/genetic_cars_2/

Часть 2. Вы учились в Стэнфордском университете?
Теперь у вас есть возможность получить такой опыт онлайн ?
Все 25 лекций Стэнфордского курса профессора Роберта Сапольски «Биология поведения человека» с переводом на русский язык!
Это полный улет!
Роберт Сапольски — американский нейроэндокринолог, профессор биологии, неврологии и нейрохирургии в Стэнфордском университете, исследователь и автор книг. Удостоен ряда высших наград, в том числе премии Карла Сагана за популяризацию науки.
Курс был прочитан в 2010 году. Перевед и озвучание студии Vert Dider
Лекция 8
Распознавание родственников
Что такое эпигенетика и как стоит интерпретировать новости об обнаружении «гена чего-либо». Способы распознавания родственников у животных, их роли в размножении и выстраивании иерархических отношений.
Лекция 9
Этология
Успешные и не очень методы изучения поведения

Переплетение серебряных нанопроволок на кремниевом чипе моделирует процесс передачи нервного сигнала в мозге. Иллюстрации Physorg
Растущую угрозу нейродегенеративных заболеваний в стареющем мире печальным образом отражает анекдот: «Я рад, что вы больны не мной. Альцгеймер». Некоторые исследователи видят причину поражений нейронов в наследстве, доставшемся нам от пещерных предков.
Археологи австралийского Университета Гриффита объявили, что нашли в одной из пещер индонезийского острова Сулавеси прекрасное изображение быка, нарисованное 44 тыс. лет назад. Об этом пишет журнал Nature. Через неделю их соотечественники из Сиднейского университета вместе с коллегами из Университета Айовы (США) сообщили в том же издании, что Homo erectus жил в пещере Ндандон на острове Ява 117 –108 тыс. лет назад и, возможно, контактировал с денисовцами,

Исследовательская работа в области машинного обучения постепенно покидает пределы университетских лабораторий и из научной дисциплины становится прикладной. Тем не менее, все еще сложно находить актуальные статьи, которые написаны на понятном языке и без миллиарда сносок. Этот пост содержит список англоязычных материалов за январь, которые написаны без лишнего академизма. В них вы найдете примеры кода и ссылки на непустые репозитории. Упомянутые технологии лежат в открытом доступе и не требуют сверхмощного железа для тестирования. Статьи поделены на четыре типа: анонсы опенсорсных инструментов, кейсы применения машинного обучения в коммерческой разработке, исследования в области ML и практические руководства по использованию PyTorch и TensorFlow. Анонсы опенсорсных технологий для машинного обучения
LaserTagger В статье кратко

Исследователи из университета Калифорнии в Дэвисе нашли в геномах людей куски древней ДНК — неандертальцев и еще одного неизвестного вымершего вида. То, что когда-то наши предки скрещивались направо и налево с представителями других ветвей человечества, — совсем не новость, и еще одна заметка об этом не может вызвать никакого желания дочитать ее до конца. Однако эта история совсем не о том, как ваш пра(пра)прадедушка любил все, что движется. Она скорее о том, почему следы первобытного распутства сохранились до наших дней. А чтобы в этом разобраться, нам придется мимоходом узнать об одном таинственном уголке нашего генома. Половина хромосом у вас от мамы, половина от папы. А у папы и мамы — половина от бабушки, половина от дедушки, и так далее вглубь поколений. Теперь считаем: всего у вас хромосом 46, от мамы из них 23, от бабушки в среднем 11,5, а от прапрапрапрабабушки в среднем около 0,7.

Эта работа поможет понять, почему два пациента с одинаковым типом опухоли совершенно по-разному реагируют на одно и то же лекарство

ТАСС, 5 февраля. Крупный международный консорциум генетиков, в число которых входили и специалисты из России, завершил расшифровку и изучение геномов 2,6 тыс. опухолей, принадлежащих к 38 видам рака. Их сравнение показало, что ДНК "новорожденных" раковых клеток в среднем содержит 4-5 опасных мутаций, пишут ученые в серии статей, опубликованных в журнале Nature.
"Наша работа поможет понять, почему два пациента с одинаковым типом опухоли совершенно по-разному реагируют на одно и то же лекарство. Геномы каждого из них уникальны, однако

Открытый доступ к визуализированным данным поможет исследователям со всего мира ускорить работу над лечением и вакцинацией против смертельного патогена.
читать далее

Все уже привыкли, что в геномах европейцев и азиатов в результате гибридизации появилось некоторое количество неандертальских фрагментов. Но оказалось, что всё немного сложнее. Новый метод оценки долей, разработанный учеными из Принстона под руководством Джошуа Эйки (Joshua Akey), сопоставляет геномы современных людей с неандертальскими независимо друг от друга и, стало быть, без априорных предположений о том, кто делал это с неандертальцами, а кто нет.

Вирусы — одни из самых маленьких форм жизни на нашей планете и в то же самое время одни из самых опасных. Постоянно развиваясь, вирусы становятся все более приспособленными и изощренными. Но все ли мы о них знаем? Недавно исследователи обнаружили новую форму вируса, в которой не содержится практически никаких известных науке генов. Таинственный вирус, собранный […]

Открывая новую главу в быстро развивающейся области иммунотерапии рака, исследовали объединили два передовых подхода: CRISPR, который позволяет редактировать ДНК, и Т-клеточную терапию, в рамках которой "бойцы" иммунной системы помогают уничтожать опухоли. Новые результаты учёные назвали успешными, методика оказалось безопасной.

Университет Эксетера исследовал наличие избытка тестостерона в теле, обусловленного генетическими факторами. Оказалось, избыток тестостерона снижает риск развития диабета 2-го типа у мужчин и повышает его у женщин.

Биологи расшифровали геном возбудителя инфекции, похожей на клещевой энцефалит и описанной Институтом эпидемиологии Роспотребнадзора. Оказалось, что вызывает ее живущая в организме клещей бактерия Borrelia miyamotoi, которую раньше не считали опасным опасной для людей.
читать далее

Масштабное исследование геномов более 425 тыс человек доказало влияние уровня тестостерона на появление и развитие ряда тяжелых заболеваний. Избыток гормона может вызывать различные типы рака и другие тяжелые заболевания. Причем у мужчин и женщин это проявляется совершенно по-разному.

На смену редактированию генома может придти совершенно новая технология исправления сбоев в организме млекопитающих, в том числе человека, на клеточном уровне. Платформа называется COMET и позволяет исследовать и изменять фундаментальные функции клеток, а также создавать новые методы лечения болезней, включая рак.
читать далее

Недавно ученые из биологической лаборатории MDI, Института исследований старения Бака и университета Нанкин потрясли медицинский мир, объявив о том, что им удалось продлить продолжительность жизни червей-нематод Caenorhabditis elegans на 500%. Черви C. elegans часто используются в исследованиях старения. Несмотря на то, что биологически они далеки от человека, эти организмы разделяют многие генетические пути с людьми. […]

Молекулярные биологи из США проанализировали структуру участков РНК неизвестного происхождения в геноме коронавируса 2019-nCoV и не нашли никаких свидетельств того, что они связаны с ВИЧ … Подробнее →

Коллектив ученых из США и Австрии воспроизвел в клеточных культурах ряд мутаций, отмеченных в геноме последних в истории мамонтов с острова Врангеля. Эксперимент подтвердил, что эти мутации оказывали вредное воздействие на животных.
Если на материке шерстистые мамонты (Mammuthus primigenius) исчезли около десяти тысяч лет назад, то на некоторых островах они продержались заметно дольше. На небольшом острове Святого Павла в Баренцевом море (входит в архипелаг Прибылова, ныне территория штата Аляска) мамонты сохранялись 5600 лет назад, а на острове Врангеля — около 4000 лет назад. В 2017 году ученые сравнили ДНК мамонта с острова Врангеля с ДНК более древнего представителя того же вида, жившего в Сибири. Они обнаружили целый ряд мутаций и предположили, что эти мутации отрицательно влияли на ряд функций организма.
Авторы нынешнего исследования решили на практике проверить, как влияли

Анализ генома вируса показал, что почти все его гены являются уникальными и не похожи ни на гены других вирусов амеб, ни на какие-либо содержащиеся в базах данных последовательности ДНК.

Около 11 000 лет на нашей планете вымерли последние популяции мамонтов. Из многотысячного вида остались только те особи, которые смогли выжить в условиях сурового климата ...

Консорциум генетиков завершил расшифровку и изучение геномов 2,6 тыс. опухолей, которые принадлежат к 38 видам рака. Их сравнение показало, что в среднем ДНК каждой появившейся опухоли содержит четыре-пять опасных мутаций на одну клетку. Об этом пишет ТАСС.
читать далее

Около 11 000 лет на нашей планете вымерли последние популяции мамонтов. Из многотысячного вида остались только те особи, которые смогли выжить в условиях сурового климата на острове Врангеля, но и они не смогли надолго сохранить свое крошечное население от вымирания. Известно, что карликовые представители крупнейших млекопитающих, обитавшие у берегов Сибири, вымерли около 4000 лет назад. […]

Раковые геномы, холодные мюоны, микроглия и воспоминания, коронавирус и здравоохранение после Брексита — таков обзор трех престижнейших научных журналов от Indicator.Ru.

На смену редактированию генома может придти совершенно новая технология исправления сбоев в организме млекопитающих, в том числе человека, на клеточном уровне. Платформа называется COMET и позволяет исследовать и изменять фундаментальные функции клеток, а также создавать новые методы лечения многих болезней, включая рак. Например, с ее помощью можно перенастроить клетки, чтобы они сами доставляли лекарства непосредственно к опухолям.

Ученые из Высшей школы медицины Университета Тохоку предложили новый метод генетической терапии, позволивший слепым от рождения мышам частично вернуть зрение. Статью о проделанной работе авторы опубликовали в Nature Communications.
читать далее

Исследователи ввели в раковые опухоли генетически измененные с помощью технологии CRISPR иммунные клетки. Достав их обратно через несколько месяцев, авторы обнаружили, что клетки были целы и невредимы и даже увеличили свою численность. Статья об открытии опубликована в журнале Science.
читать далее

<img src="https://naked-science.ru/wp-content/uploads/2020/02/ucscgenomebr.jpg" alt="В интернет выложили полный геном коронавируса 2019-nCoV"/>Открытый доступ к визуализированным данным поможет исследователям со всего мира ускорить работу над лечением и вакцинацией против смертельного патогена.

Исследование подтвердило, что последняя популяция мамонтов, обитавшая на острове Врангеля, страдала от накопления вредоносных мутаций. В частности, животные частично утратили способность к обонянию, у них плохо работала инсулиновая система, страдала мужская фертильность. Первопричиной всех этих изменений и в конечном счете гибели популяции стала немногочисленность этой группы - они вымерли из-за близкородственных скрещиваний.

Сколько лет нам отмерили эпигенетические часы

Американским ученым удалось генетически отредактировать иммунную систему трех больных раком, используя технологию CRISPR, не создав побочных эффектов. Об этом сообщает Science Alert.

Американская фармакомпания Regeneron, которая разработала самый эффективный (на сегодняшний день) препарат для лечения лихорадки Эбола (REGN-EB3), собирается повторить успех с 2019-nCoV. Идея в том, чтоб использовать ту же технологию, что и для REGN-EB3 - моноклональные антитела, взятые у пациентов, перенесших болезнь. Кристос Кирацоус (на фото), вице-президент Regeneron по инфекционным заболеваниям, говорит, что кроме отработанной технологии, преимуществом его компании являются генно-модицифицированные мышки, которые имеют "человеческую" иммунную систему. Говорит, если повезет, новый препарат будет готов к испытаниям на людях через 10 месяцев. Однако, как и в случае с Эболой, эффективность таких препаратов достаточно высока только если их принимать в первый-второй день болезни. Помогать Regeneron в создании препарата будет американский Минздрав (HHS).

Биологи расшифровали геном возбудителя инфекции, похожей на клещевой энцефалит и описанной Институтом эпидемиологии Роспотребнадзора. Оказалось, что вызывает ее живущая в организме клещей бактерия Borrelia miyamotoi, которую раньше не считали опасным опасной для людей. Работа, которая поможет в изучении пути передачи и развития патогена, опубликована в BMC Genomics.

Начатые в 2019 году клинические исследования доказали длительный эффект от CRISPR-терапии у онкопациентов. Это открывает новые возможности для безопасного лечения не только рака, но и других тяжелых заболеваний, часто неизлечимых.
читать далее

Как рентгеновская кристаллография позволила ученым заглянуть внутрь непрозрачных объектов, какую строчку из всего интеллектуального наследия человечества считал самой важной Ричард Фейнман, и как любовь отвлекает одних ученых от работы, а других приводит к «Нобелевке», читайте в главе из книги лауреата этой премии Венки Рамакришнан.

«Золотой рис» впервые одобрен как безопасная для потребления человеком и животными культура. Генетически модифицированный сорт риса призван спасти миллионы жизни в бедных регионах Земли. Об этом пишут на сайте Университета Вашингтона в Сент-Луисе.

Ученые из Высшей школы медицины Университета Тохоку предложили новый метод генетической терапии, позволивший слепым от рождения мышам частично вернуть зрение. Модифицированный метод «подсадки» здорового гена … Подробнее →

Исследователи ввели в раковые опухоли генетически измененные с помощью технологии CRISPR иммунные клетки. Достав их обратно через несколько месяцев, авторы обнаружили, что клетки были целы и невредимы и даже увеличили свою численность. Статья об открытии опубликована в журнале Science.

<img src="https://naked-science.ru/wp-content/uploads/2020/02/newgenethera.jpg" alt="Отредактированный геном помог мышам с врожденной слепотой"/>Модифицированный метод «подсадки» здорового гена позволил добиться результата от генной терапии в тех случаях, в которых ранее это было невозможно. В ближайшие годы он будет протестирован на людях.

Группа японских исследователей обнаружила ген, который связан с активацией мейоза в клетках. При его отключении особи мышей обоих полов становились бесплодными. О своем открытии ученые сообщили в журнале Developmental Cell.

Крупнейшее исследование генетических основ рака в истории науки показало, что анализ некодирующей ДНК может помочь выявлять те виды этого заболевания, которые сложно обнаружить сейчас. Кроме того, развитие онкологических болезней возможно диагностировать на десятилетия раньше, чем позволяют используемые сегодня методики.
читать далее